異性装は宗教儀式の一環として行われることもある。異性に属する神秘的な力を取り込む目的や、神が行った異性装を模倣する目的などがある。
例えば古代ギリシアではヘラクレスに仕える神官（男性）はヘラクレスに倣って女装を行った。
稚児にさせるかむろも幼年時の男児を女性とも取れる中性的な容姿にすることで、このような魔物から守る例から派生したと考えられている。
女性が男装をして舞う白拍子は宗教的行事のみならず芸能にも通じる。
他にも、男児に女装させる百石踊り（兵庫県三田市の駒宇佐八幡神社[2]）という雨乞い神事、村の長男に女装させる福島県会津美里町の早乙女踊り、男児が早乙女姿で田植えする諸田山神社（大分県国東市）の御田植祭り、氏子の男子が巫女装束で舞いを奉納する玉置神社（奈良県十津川村）例祭、稚児に女装させ舞わせる白鬚神社の田楽（佐賀市））などが挙げられる。その多くが元服前10歳から15歳前後以前の男子や男児に女装させる神事が日本各地に存在する。
近代日本では大本教教祖（正しくは男性聖師）の出口王仁三郎がしばしば女性装を行っていた。
女性の生命を生み出す力を取り込むための女装は原始宗教の中に広く見られる。
また、魔物に子供をとられないように、と、子供に異性装をさせるケースもある。これは魔物が目当ての子供を見つけられない、と考えて行われた。地域によっては病弱な子供だけ、という場合もあったようである。簡略として、男の子の髪型を垂髪にする、という場合も合った（南方熊楠がこれをやらされていた）。
アメリカでは、文化と宗教上の理由により、男子は6または7歳になるまで、社会規範としてジェンダーニュートラルな衣類、白いドレスなどの女子用の子供服を着せていた。その一例が、第32代アメリカ大統領、フランクリン・ルーズベルトの2歳半で撮影された幼少期の写真であり、当時の社会的慣習により、男の子は6歳か7歳まで女の子として扱われ、白いドレス、パテントレザーの靴、羽の帽子と長い髪といった中性的な衣装で過ごしていた。
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