体温を測定する場合、体温計やサーモグラフィーが用いられる。体温計は脇の下や耳などといった体の外側の部分を計測する機器である。サーモグラフィーは体内から放射される遠赤外線から体温を測定するもので、体の広い範囲の体温を図として見ることができる。
人間の体温の測定は、通常は測定しやすい腋窩や口腔、直腸にプローブ（体温計）を挿入して測定する。体温は環境温度の影響を受けにくい身体深部の温度を核心温度（深部体温）、影響を受けやすい表層の温度を外殻温度（皮膚温、体表面温）という。
核心温度は、環境の変動によっても温度が変化しない生態の核心部（頭腔、胸腹腔など身体深部）の温度で、外殻温度と異なり体温調節により一定に調節されている（恒温動物で37℃くらい）。直腸温、口腔温、腋窩温、鼓膜温が測定される。通常、直腸温は腋窩温よりも0.5℃高い。温度センサーつきのカテーテル類で膀胱温や肺動脈血温などが測定可能である。赤外線鼓膜体温計や体表から深部の温度を測定可能な深部体温計の開発もされている。
外殻温度は、生態の外層部の温度であり、環境温度によって変化する。対表面に近いほど環境温度に近くなる。一般的に、核心温度は37℃前後であり、外殻温度は34℃程度である。その環境によって変動の幅は大きい。体表面温度はサーモグラフィなどで計られる。
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